南方医科大学基础医学院的前身为中国人民解放军第一军医大学基础部，成立于1951年，2004年8月随学校移交广东省后更名为基础医学院。 学院现有生物学和基础医学2个一级学科博士授权学科和博士后科研流动站，下设14个科室。拥有1个国家重点学科、1个国家重点(培育)学科、2个“长江学者”特聘教授岗位学科，2个广东省重点一级学科，9个广东省重点实验室，1个广东省创伤救治科研中心，1个广东省国际合作基地等一批处于国内先进水平的科研基地和实验技术平台。 学院现有教职工265人，其中专任教师180人，教授65人、副教授55人；博士生导师54人、硕士生导师48人；具有博士学位的教师占82%以上。拥有中国科学院院士1名，中国工程院院士1名；国家级教学名师2人，全国模范教师和全国优秀教师3人，“国家千人”计划入选者6人（其中青年千人4人），“长江学者”6人，973项目首席科学家1人，国家杰青6人，国家优青2人，享受政府特殊津贴者18人。 先后有30余人次获中国青年科技奖、“新世纪百千万人才工程”国家级人选、广东省科学技术突出贡献奖、广东省丁颖科技奖、南粤优秀教师等荣誉。拥有教育部创新团队2个，国家级教学团队2个，广东省创新科研团队2个。 2009年被评为“全国教育系统先进集体”。学院在临床应用解剖学、神经元凋亡与抑郁症机制、地中海贫血诊治、鼻咽癌及大肠癌发生与转移机理、细胞信号转导、休克微循环、听觉神经机制及可塑性、造血生殖发育与疾病等研究领域具有较大的学术影响。 2005年以来，学院共承担各类竞争性科研项目（含科技人才项目）657项，其中国家级科研课题389项，经费共计4.01 亿元。先后主持国家自然科学基金重点项目、国家科技支撑计划项目、“973”、“863”项目、教育部“长江学者和创新团队发展计划”等国家级重点项目54项；作为第一完成单位先后获得省部级以上科技成果12项，其中国家自然科学奖二等奖1项，国家科技进步奖二等奖1项，广东省科学技术突出贡献奖1项，广东省科学技术一等奖5项。以通讯作者单位发表SCI收录论文886篇，其中影响因子大于10分论文35篇（第一署名单位论文20篇）。

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