深圳市中医院始建于1975年，下属机构有深圳市中医药研究所、深圳市国际中医药人才培训中心、深圳市中药制剂中心。医院于1995年成为三级甲等中医医院；1998年成为广州中医药大学第一家非直属附属医院；2012年成为广州中医药大学第四临床医学院，在深圳市基本医疗服务体系中医药领域中起着领头羊的作用。2014年9月获批立项的深圳市中医院光明院区已于2017年10月破土动工。该院区规划床位2000张，建筑面积52.98万平方米。预计2024年6月开业，之后医院将形成福田院区、光明院区、针灸医院、科教中心“一院四区”的格局，成为国际化、大型现代化综合性研究型中医院和区域性中医医疗中心。 医院现有职工近2000人，其中卫生技术人员1620人，高级职称500余人，国家、省市名中医40余人。医院医疗设备总值超过6亿元，拥有多台科研型MRI和CT机、数字一体化手术室、手术机器人、3D腹腔镜、四维高端彩超等高精尖医疗设备。目前，医院年门急诊量逾200万人次，开放床位近千张，年出院病人3.5万余人次，已成为集医疗、教学、科研、预防、保健、康复为一体的大型综合性三级甲等中医医院。 医院坚持“科教兴院”战略，拥有国家中医药管理局中医药科研三级实验室——临床细胞分子生物学实验室、国家药物临床实验基地（获认定8个专业）、中华中医药学会临床药师培训基地、深圳市民生重点实验室——针灸现代应用研究实验室，入选国家中医药传承创新工程备选项目。在研课题160余项，医院牵头承担“十一五”、“十二五”、“十三五”科技重大专项各1项；国家自然科学基金科研课题30余项，获得国家省市科技进步奖20余项。 医院先后成为广州中医药大学博士后科研流动站研究基地，广东省和深圳市“博士后创新实践基地”、“广东省联合培养研究生示范基地”、国家“博士后科研工作站”，现有18位博士生导师、64位硕士生导师，有36个临床教研室，已形成博士、硕士、本科多层次的教学体系。在对外交流方面，医院先后与美国Thomas Jefferson 大学、德国Medical Park康复医院建立协作关系，与香港中文大学中医学院、香港浸会大学中医学院、香港执业中医师学会、香港中医学会会立中医学院、香港国际针灸学院等建立了固定的教学协作及学术交流关系；医院有20多个专业学术团体挂靠医院成立。

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