医院始建于1934年，为新疆第一家西医医院，已有90年的建院历史。1997年6月1日，由自治区人民政府批准、原自治区卫生厅挂牌命名为“乌鲁木齐儿童医院”。2002年，乌鲁木齐县人民医院整建制并入命名为“乌鲁木齐市第一人民医院分院”。2021年12月底，城北院区试运行，2022年3月全面投入使用。目前，我院由北门院区、铁路局院区和城北院区三个院区组成。现编制床位1320张，实际开放床位1450张（其中，北门院区编制床位370张，开放430张；铁路局院区编制床位700张，开放710张；城北院区建设床位1200张，批复床位250张，开放310张）。 北门院区：即乌鲁木齐儿童医院，位于乌鲁木齐市天山区健康路1号，是自治区唯一一家集医疗、科研、教学、保健、康复为一体的综合性三级甲等儿童专科医院。医院占地面积18亩，建筑面积4.36万平方米。是国家儿童健康与疾病临床医学研究中心核心成员单位、国家小儿麻醉医师培训基地、国家级儿科住院医师规范化培训基地、国家儿童临床营养研究中心、中国儿童全血C反应蛋白检测质量要求指南研究分中心、中国妇儿临床实验诊断指标标准化建设分中心，天津医科大学研究生联合培养单位、浙江大学附属儿童医院心脏中心新疆分中心、新疆小儿AHA高级生命支持培训基地、自治区残疾儿童康复干预治疗中心、乌鲁木齐地区急危重症儿童救治中心；乌鲁木齐市儿科诊疗质量控制中心、乌鲁木齐市医院感染管理质量控制中心、乌鲁木齐市临床检验质量控制中心挂靠单位。有新疆医科大学硕士生导师9人。 铁路局院区：即乌鲁木齐市第一人民医院分院，地址：乌鲁木齐市新市区河南东路806号，是一家集医疗、科研、教学、保健、康复为一体，以妇女儿童诊疗为突出特色的二级甲等综合医院。医院占地面积30亩，建筑面积9.75万平方米。年分娩量多年位列乌鲁木齐地区前三名。 城北院区：位于乌鲁木齐市高新区（新市区）北辰六街3666号，院区建设项目于2016年5月立项，2017年9月开始建设，2021年12月底试运行，2022年3月正式投入使用。院区占地面积164亩，总建筑面积23.06万平方米（地上建筑面积16.42万平方米，地下建筑面积6.64万平方米） 。含综合楼、康复保健中心、儿保中心、感染中心、血液中心、科研教学楼六个单体建筑，院区内设置停车位1680个。总投资28.30亿元，其中基础建设投资24.24亿元，设备投资4.10亿元，建设床位1200张。

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